Pentagon kaller hendelsen pinlig, men sier den ikke utgjør noen sikkerhetstrussel.
En gruppe som kaller seg CyberKalifatet, har også sendt ut meldinger som hyller Den islamske staten (IS) og sier den fortsetter sin jihad på nettet.
Kontoen som er hacket, tilhører USAs Central Command (CENTCOM), som har ansvaret for USAs militære aktivitet i Nord-Afrika, Midtøsten og Sentral-Asia.
CENTCOMs logo ble mandag byttet ut med et bilde av en person med tildekket ansikt, en IS-logo og teksten «Jeg elsker dere, IS».
Les også: Dette er kortsvindlernes 5 sleipeste teknikker
Interne dokumenter
«Amerikanske soldater, vi kommer, vær på vakt!» og «Vi gir oss ikke. Vi vet alt om dere, konene deres og barna deres» er blant meldingene som ble lagt ut.
I tillegg er det som ser ut til å være interne dokumenter blitt publisert, inkludert lister over navn og adresser på pensjonerte generaler.
Også dokumenter som tilsynelatende viser etterretning om Nord-Korea og Kina er lagt ut på Twitter.
Les også: Slik ble datahacking fremstilt i 80-tallsfilmer
YouTube
Gruppen har også hacket en YouTube-konto som tilhører CENTCOM. Her har de lagt ut det som ser ut til å være flere jihadistiske propagandavideoer.
Det tok omtrent tre kvarter fra Twitter-kontoen ble hacket til den ble stengt av Twitter mandag kveld.
Det amerikanske forsvarsdepartementet Pentagon bekrefter hackerangrepet og sier at også YouTube-kontoen er midlertidig stengt etter angrepet. Oberst Patrick Ryder sier til ABC News at forsvaret tar «nødvendige grep for å håndtere saken».
Central Command har sitt hovedkvarter i Tampa i Florida, men har baser i hele regionen den dekker. Krigene i Irak og Afghanistan er noe av den militære innsatsen som har vært ledet av CENTCOM.
Les også:
10 triks for bedre wifi hjemme